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Authors
Advisor(s)
Abstract(s)
The Landim pigs of Mozambique are an important local breed raised by small-scale
farmers in extensive system, predominantly sustained by leftover food. These pigs serve
as a cornerstone for the economic stability of these communities. However, their
existence is currently jeopardized by unregulated crossbreeding with commercial pig
breeds. Preserving these local pigs is crucial due to their role as a source of genetic
diversity. To this end, we have conducted whole genome resequencing on six Landim
pigs, characterizing their genetic makeup and establishing their relationship with other
pig breeds worldwide. Our findings indicate that Landim pigs are more closely related to
European cosmopolitan breeds, particularly showing a closer genetic relation with
Angolan pigs. Furthermore, we have identified genetic signatures linked to enhanced
meat quality and reproductive traits. This ground-breaking whole genome
characterization of Landim pigs lays the groundwork for future conservation initiatives.
Os suínos Landim de Moçambique representam uma importante raça local, criada por agricultores familiares num sistema de produção extensivo, predominantemente alimentados com restos de comida. Estes suínos servem como pedra angular para a estabilidade económica destas comunidades. No entanto a sua existência está atualmente ameaçada pelo cruzamento não regulado com raças de suínos comerciais. Preservar estes suínos locais é crucial devido ao seu papel como fonte de diversidade genética. Para este fim, realizámos a resequenciação do genoma de seis suínos Landim, caracterizando sua composição genética e investigando a sua relação com outras raças de suínos no mundo. Os resultados deste estudo indicam que os suínos Landim têm maior semelhança genética com as raças cosmopolitas europeias, mostrando elevada semelhança com os porcos locais angolanos. Apesar desta semelhança os porcos Landim apresentaram um grau de diferenciação que sugere que tenham alelos únicos na espécie. A análise de assinaturas de seleção genética mostrou que a seleção destes animais poderá ter incidido em regiões do genoma associadas a caraterísticas relacionadas com a qualidade da carne e com características reprodutivas. Este trabalho demonstrou que os suínos Landim são um recurso genético único e e que devem ser desenvolvidas futuras iniciativas no âmbito da sua conservação.
Os suínos Landim de Moçambique representam uma importante raça local, criada por agricultores familiares num sistema de produção extensivo, predominantemente alimentados com restos de comida. Estes suínos servem como pedra angular para a estabilidade económica destas comunidades. No entanto a sua existência está atualmente ameaçada pelo cruzamento não regulado com raças de suínos comerciais. Preservar estes suínos locais é crucial devido ao seu papel como fonte de diversidade genética. Para este fim, realizámos a resequenciação do genoma de seis suínos Landim, caracterizando sua composição genética e investigando a sua relação com outras raças de suínos no mundo. Os resultados deste estudo indicam que os suínos Landim têm maior semelhança genética com as raças cosmopolitas europeias, mostrando elevada semelhança com os porcos locais angolanos. Apesar desta semelhança os porcos Landim apresentaram um grau de diferenciação que sugere que tenham alelos únicos na espécie. A análise de assinaturas de seleção genética mostrou que a seleção destes animais poderá ter incidido em regiões do genoma associadas a caraterísticas relacionadas com a qualidade da carne e com características reprodutivas. Este trabalho demonstrou que os suínos Landim são um recurso genético único e e que devem ser desenvolvidas futuras iniciativas no âmbito da sua conservação.
Description
Mestrado em Engenharia Zootécnica - Produção Animal. Universidade de Lisboa, Instituto Superior de Agronomia, Faculdade de Medicina Veterinária
Keywords
pigs selection África landim whole genome sequencing suínos seleção resequenciação de genoma
Pedagogical Context
Citation
Teixeira, F.M.C. Whole genome sequencing of Landim pigs from Mozambique to unravel ancestry and selection. Lisboa: ISA-Universidade de Lisboa, 2023, 67 p. Dissertação de Mestrado
Publisher
Instituto Superior de Agronomia, Universidade de Lisboa