Publicação
Targeted microbiome analysis in Human health and precision medicine
| dc.contributor.author | Pinheiro, Henrique Simões | |
| dc.contributor.institution | University of Lisbon | |
| dc.contributor.supervisor | Refinetti , Paulo | |
| dc.contributor.supervisor | Santos, André Fernando Anastácio dos | |
| dc.date.accessioned | 2026-03-13T15:55:01Z | |
| dc.date.available | 2026-03-13T15:55:01Z | |
| dc.date.issued | 2025-11-17 | |
| dc.description | Tese de mestrado, Ciências Biofarmacêuticas, 2025, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia. | |
| dc.description.abstract | Staphylococcus aureus é uma bactéria Gram-positiva comumente presente no organismo humano e associada a diversas doenças e infeções, tais como pneumonia, sífilis e infeções de pele e tecidos moles. Até à década de 1990, as infeções por S. aureus resistente à meticilina (MRSA) ocorriam principalmente em contexto hospitalar. Contudo, a partir dos anos 2000, verificou-se um aumento global de casos de infeções por MRSA fora dos hospitais, num cenário designado por MRSA adquirido na comunidade. Estes surtos tornaram-se mais frequentes e podem propagar-se facilmente a indivíduos saudáveis. Como as estirpes de MRSA são resistentes à maioria dos antibióticos β-lactâmicos e frequentemente transportam genes adicionais de resistência, as opções terapêuticas disponíveis para o tratamento de indivíduos infetados são muitas vezes severamente limitadas. Assim, torna-se crucial acelerar a identificação das estirpes de MRSA em caso de infeção. No entanto, os testes atualmente disponíveis requerem, pelo menos, 2 a 4 dias, limitando as opções de tratamento e a janela terapêutica. Neste contexto, propõe-se o desenvolvimento de uma ferramenta de diagnóstico capaz de identificar MRSA em amostras complexas num único dia. Para além disso, o baixo custo do teste permite a sua utilização em países em desenvolvimento, onde, devido a recursos limitados, as ferramentas de diagnóstico não são empregues de forma ideal. Esta situação é preocupante, uma vez que esses países podem constituir pontos de partida para surtos e para o aparecimento de novos genes de resistência. Assim, é essencial que o ensaio esteja acessível ao maior número possível de indivíduos. Para tal, foram especificamente desenhados primers utilizando o software da REM Analytics, combinados com a Eletroforese Capilar com Temperatura Cíclica (CTCE – Cycling Temperature Capillary Electrophoresis), permitindo distinguir MRSA de Staphylococcus aureus sensível à meticilina. | pt |
| dc.description.abstract | Staphylococcus aureus is a gram-positive bacterium commonly present in the human body and associated with various diseases and infections, such as pneumonia, syphilis or skin and soft skin infections. Until the 1990’s methicillin- resistant S. aureus infections occurred mainly in hospitals. However, from the 2000s onward, there has been an increase in cases of methicillin-resistant S. aureus infections all over the world, on a different scenario than before, known as community-acquired methicillin- resistant S. aureus. As community-acquired methicillin-resistant S. aureus outbreaks have become more frequent and can easily spread to healthy individuals. Since methicillin- resistant S. aureus strains are resistant to most β-lactam antibiotics and often carry additional resistance genes, the therapeutic options that can be used to treat infected people is often drastically limited. Thus, it is crucial to speed up the identification of methicillin- resistant S. aureus strains, in case of infection. However, the available tests require at least 2-4 days, limiting treatment options and therapeutic windows. Here, we propose to develop a diagnostic tool to enable the identification of methicillin-resistant S. aureus in complex samples within one day. At the same time, the low-cost of the test allows for it to be used in underdeveloped countries, where due to low-resources, diagnostic tools are not as used as ideally, they would be. This is cause for concern, since those countries can be big starting points for outbreaks and the appearance of other resistance genes. It is then crucial that the assay can be available to as many individuals as possible. For that, primers were specifically designed using REM Analytics software and combined with the use of Cycling Temperature Capillary Electrophoresis, allowing to distinguish methicillin- resistant S. aureus from methicillin- sensitive S. aureus . | en |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10400.5/117571 | |
| dc.language.iso | eng | |
| dc.subject | 204180996 | |
| dc.subject | Staphylococcus aureus | |
| dc.subject | Antibiotic resistance | |
| dc.subject | MRSA | |
| dc.subject | MSSA | |
| dc.subject | mecA gene | |
| dc.subject | CTCE | |
| dc.subject | Teses de mestrado - 2025 | |
| dc.title | Targeted microbiome analysis in Human health and precision medicine | en |
| dc.type | master thesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| rcaap.rights | openAccess |
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