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Molecular variability of different species of cyathostomins in selected hosts

2019-11-26Dissertação de mestrado Acesso aberto
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authorProfile.affiliationCarvalho, Luís Manuel Madeira de
dc.contributor.advisorSamson-Himmelstjerna, Georg von
dc.contributor.advisorCarvalho, Luís Manuel Madeira de
dc.contributor.authorLouro, Mariana Isabel Caseiro
dc.date.accessioned2019-12-16T16:17:46Z
dc.date.available2021-05-26T00:30:17Z
dc.date.issued2019-11-26
dc.descriptionDissertação de Mestrado Integrado em Medicina Veterináriapt_PT
dc.description.abstractCyathostomins are important intestinal nematode parasites of equids and include more than 50 accepted species. Their taxonomy has been frequently revised and sometimes the presence of cryptic species was suggested. Besides, usually molecular- and morphology-based phylogenetic analyses give divergent results. In this study, the nucleotide sequences of the second internal transcribed spacer (ITS-2) and cytochrome c oxidase subunit I (COI) of nuclear ribosomal DNA and mitochondrial DNA, respectively, were determined for adults of six cyathostomin species (Cylicocyclus nassatus, Coronocyclus labiatus, Coronocyclus coronatus, Cylicostephanus longibursatus, Cylicostephanus minutus, Cylicostephanus calicatus) from hosts of two geographic regions (domestic horses from Germany; a Przewalski horse, a donkey, a kulan, a zebra and a horse from Ukraine). Maximum likelihood trees were calculated for ITS-2, COI and combined data sets. No obvious differentiation was detected between geographic regions, nor equine host species. The ITS-2 was unable to separate between Coronocyclus coronatus and some Cylicostephanus calicatus sequences. Although COI sequence-based analysis easily distinguished them, they also revealed a close relationship between these two species. Cryptic species were detected in Cylicostephanus minutus and Cylicostephanus calicatus. Cylicocyclus nassatus and Coronocyclus labiatus showed diverse and mixed mitochondrial and nuclear haplotypes, while Cylicostephanus longibursatus was comparatively homogenous. In conclusion, combined analysis of nuclear and mitochondrial haplotypes from the same specimen, improved resolution of analyses and should be applied to more species and hosts from various geographic regions.pt_PT
dc.description.abstractRESUMO - Variabilidade molecular de diferentes espécies de ciatostomíneos em hospedeiros selecionados - Os ciatostomíneos são parasitas nematodes intestinais importantes dos equídeos e incluem mais de 50 espécies reconhecidas como tal. A sua taxonomia tem sido frequentemente revista e a presença de espécies crípticas foi sugerida algumas vezes. Além disso, análises filogenéticas baseadas na morfologia ou sequências moleculares dão, por norma, resultados divergentes. Neste estudo, as sequências nucleotídicas do segundo espaçador interno transcrito (ITS-2) e citocromo c oxidase I (COI) do DNA ribossómico nuclear e do DNA mitocondrial, respetivamente, foram determinadas para adultos de seis espécies de ciatostomíneos (Cylicocyclus nassatus, Coronocyclus labiatus, Coronocyclus coronatus, Cylicostephanus longibursatus, Cylicostephanus minutus, Cylicostephanus calicatus) de hospedeiros de duas regiões geográficas (cavalos domésticos da Alemanha; um Przewalski, um burro, um kulan, uma zebra e um cavalo da Ucrânia). As árvores de máxima verossimilhança foram calculadas para conjuntos de dados de ITS-2, COI e combinados. Não foi detetada nenhuma diferenciação óbvia entre regiões geográficas, nem entre espécies hospedeiras equinas. O ITS-2 foi incapaz de separar Coronocyclus coronatus e algumas sequências de Cylicostephanus calicatus. Embora as sequências de COI as distinguissem facilmente, revelaram também uma estreita relação entre essas duas espécies. Para Cylicostephanus minutus e Cylicostephanus calicatus foram detetadas espécies crípticas. Cylicocyclus nassatus e Coronocyclus labiatus apresentaram diversos haplótipos mitocondriais e nucleares, enquanto que Cylicostephanus longibursatus foi comparativamente mais homogéneo. Em conclusão, a análise combinada de haplótipos nucleares e mitocondriais das mesmas espécies, melhorou a resolução das análises e deve ser aplicada a mais espécies e hospedeiros de várias regiões geográficas.pt_PT
dc.description.versionN/Apt_PT
dc.identifier.citationLouro MIC 2019. Molecular variability of different species of cyathostomins in selected hosts. [dissertação de mestrado]. Lisboa: FMV-Universidade de Lisboa.pt_PT
dc.identifier.tid202374750
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10400.5/19044
dc.language.isoengpt_PT
dc.publisherUniversidade de Lisboa, Faculdade de Medicina Veterináriapt_PT
dc.relationDeutscher Akademischer Austauschdienst (DAAD) (funding program 57210259pt_PT
dc.relationDeutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) – Projektnummer 251133687 / GRK 2046pt_PT
dc.relationErasmus + program (contract number 035448 86/SMT/2017) of the European Unionpt_PT
dc.subjectStrongylidaept_PT
dc.subjectCyathostominaept_PT
dc.subjectEquidspt_PT
dc.subjectphylogenetic analysispt_PT
dc.subjectITS-2pt_PT
dc.subjectCOIpt_PT
dc.subjectanálise filogenéticapt_PT
dc.subjectEquídeospt_PT
dc.subjectEquídeospt_PT
dc.subjectanálise filogenéticapt_PT
dc.titleMolecular variability of different species of cyathostomins in selected hostspt_PT
dc.typemaster thesis
dspace.entity.typePublication
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rcaap.rightsopenAccesspt_PT
rcaap.typemasterThesispt_PT

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