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Publicação

Mesophilic Aeromonas in threatened Iberian leuciscids : conservation and public health implications

2022-02-17Tese de doutoramento Acesso aberto
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dc.contributor.advisorOliveira, Maria Manuela Castilho Monteiro de
dc.contributor.advisorRobalo, Joana Isabel Espírito Santo
dc.contributor.authorGrilo, Miguel
dc.date.accessioned2022-03-24T22:45:36Z
dc.date.available2022-03-24T22:45:36Z
dc.date.issued2022-02-17
dc.descriptionTese de Doutoramento em Ciências Veterinárias na Especialidade de Sanidade Animalpt_PT
dc.description.abstractDespite the high risk of extinction of the Iberian leuciscids, the impact of bacterial diseases on their conservation is unknown. A comprehensive knowledge of the interaction between these species and pathogens, such as mesophilic Aeromonas, as well as the development of biosafety measures for ex situ programs, are considered essential for the success of their conservation. The main objectives of this thesis are the evaluation of the epidemiology of mesophilic Aeromonas in Iberochondrostoma lusitanicum, as well as the characterization of their antimicrobial resistance and virulence profiles, the detection of differences in the diversity of Aeromonas spp. of I. lusitanicum and Squalius pyrenaicus, the evaluation of the potential of biosecurity measures in the control of Aeromonas spp. in ex situ programs and testing the effect of climate change on Aeromonas spp. The results showed that I. lusitanicum presented lower general health status in the dry season, varying with location. Aeromonas communities varied between seasons and locations, while their pathogenic potential increased in the dry season. Relevant resistance phenotypes (carbapenems and fluoroquinolones) were detected. Furthermore, I. lusitanicum and S. pyrenaicus showed different levels of skin lesions, with S. pyrenaicus being the most affected species. Aeromonas communities differed between the two fish species. Additionally, the use of biosecurity measures suggests a decrease in the prevalence of Aeromonas spp. in ex situ programs, as well as its pathogenicity to fish, while an increase in antimicrobial resistance was observed throughout the program. Finally, climate change predicted by the International Panel on Climate Change for water temperature and pH influenced the growth, biofilm production and antimicrobial resistance profiles of Aeromonas spp. The current results clarify the epidemiology of mesophilic Aeromonas in threatened Iberian leuciscids and contribute to the establishment of adequate conservation measures.pt_PT
dc.description.abstractRESUMO - Apesar do elevado risco de extinção dos leuciscídeos ibéricos, desconhece-se o impacto das doenças bacterianas na sua conservação. Um conhecimento abrangente sobre a interação entre estas espécies e agentes patogénicos, como Aeromonas mesofílicas, bem como o desenvolvimento de medidas de biossegurança para programas ex situ, são considerados essenciais para o sucesso da sua conservação. Os principais objetivos desta tese são a avaliação da epidemiologia de Aeromonas mesofílicas em Iberocondrostoma lusitanicum, bem como a caracterização dos seus perfis de resistência antimicrobiana e virulência, a deteção de diferenças na diversidade de Aeromonas spp. de I. lusitanicum e Squalius pyrenaicus, a avaliação do potencial de medidas de biossegurança no controlo de Aeromonas spp. em programas ex situ e a testagem do efeito de alterações climáticas em Aeromonas spp. Os resultados mostraram que I. lusitanicum apresentaram estado geral de saúde inferior na época seca, variando com a localização. As comunidades de Aeromonas variaram entre épocas e localizações, enquanto o seu potencial patogénico aumentou na época seca. Foram detetados fenótipos de resistência relevantes (carbapenemos e fluroquinolonas). Além disso, I. lusitanicum e S. pyrenaicus apresentaram diferentes níveis de lesões cutâneas, sendo S. pyrenaicus a espécie mais afetada. As comunidades de Aeromonas diferiram entre as duas espécies de peixes. Adicionalmente, o uso de medidas de biossegurança sugere uma diminuição na prevalência de Aeromonas spp. em programas ex situ, bem como da sua patogenicidade para peixes, enquanto foi observado um aumento da resistência antimicrobiana ao longo do programa. Finalmente, as alterações climatéricas previstas pelo Painel Internacional sobre Mudanças Climáticas para a temperatura e pH da água influenciaram o crescimento, a produção de biofilme e os perfis de resistência antimicrobiana de Aeromonas spp. Os resultados atuais esclarecem sobre a epidemiologia de Aeromonas mesofílicas em leuciscídeos ibéricos ameaçados e contribuem para o estabelecimento de medidas de conservação adequadaspt_PT
dc.description.versionN/Apt_PT
dc.identifier.citationGrilo MLA. 2022. Mesophilic Aeromonas in threatened Iberian leuciscids : conservation and public health implications [dissertation]. Lisboa: FMV-Universidade de Lisboa.pt_PT
dc.identifier.tid101552742
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10400.5/23902
dc.language.isoengpt_PT
dc.publisherUniversidade de Lisboa, Faculdade de Medicina Veterináriapt_PT
dc.relationPhD Fellowship (C10571K) from Universidade de Lisboapt_PT
dc.relationCentre for Interdisciplinary Research in Animal Health
dc.relationCIISA-2019-11: “Unravelling susceptibility patterns to infectious diseases in endangered endemic leuciscids: exploring MHC class II β alleles polymorphisms as a predictive conservation tool”pt_PT
dc.relationMARE/UIDB/MAR/04292/2020 and strategic project MARE/UIDP/MAR/04292/2020 funded by Fundação Ciência e Tecnologia, I.P.pt_PT
dc.relationGrant “A. hydrophila in Iberochondrostoma lusitanicum” from the Zebra Foundation for Veterinary Zoological Educationpt_PT
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/pt_PT
dc.subjectAeromonas spp.pt_PT
dc.subjectIberochondrostoma lusitanicumpt_PT
dc.subjectSqualius pyrenaicuspt_PT
dc.subjectAntimicrobial resistancept_PT
dc.subjectVirulencept_PT
dc.subjectResistência antimicrobianapt_PT
dc.subjectVirulênciapt_PT
dc.titleMesophilic Aeromonas in threatened Iberian leuciscids : conservation and public health implicationspt_PT
dc.typedoctoral thesis
dspace.entity.typePublication
oaire.awardTitleCentre for Interdisciplinary Research in Animal Health
oaire.awardURIinfo:eu-repo/grantAgreement/FCT/6817 - DCRRNI ID/UIDB%2F00276%2F2020/PT
oaire.fundingStream6817 - DCRRNI ID
person.familyNameGrilo
person.givenNameMiguel
person.identifier.ciencia-id4B17-DF6F-1A51
person.identifier.orcid0000-0001-7364-821X
person.identifier.scopus-author-id57195729611
project.funder.identifierhttp://doi.org/10.13039/501100001871
project.funder.nameFundação para a Ciência e a Tecnologia
rcaap.rightsopenAccesspt_PT
rcaap.typedoctoralThesispt_PT
relation.isAuthorOfPublication1f136cc1-1f56-40b3-971b-aab3edaa7cab
relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscovery1f136cc1-1f56-40b3-971b-aab3edaa7cab
relation.isProjectOfPublication8563a044-0c86-49a8-a275-8b1bb62cc0d8
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