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Publicação
Synthesis of photo-affinity labelling reagent to probe HSP90 C-terminal structure-activity relationships
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Orientador(es)
Resumo(s)
The 90 kDa Heat Shock Protein (Hsp90) is a chaperone protein responsible for regulating the activity of hundreds of structurally diverse client proteins in the cytosol, by providing assistance to their correct folding. In tumours Hsp90 is frequently found to be overexpressed assisting metastable proteins to remain active by stabilizing their conformation and helping them evade the biological degradation mechanisms.
Over the past two decades, Hsp90 has become the focus of intense research activity as a possible target in new cancer therapies with drug candidates entering clinical trials targeting the well-known NTD of the protein, but these drugs have generally unfavourable pharmacokinetics and high potential for rebound adverse reactions.
In the last few years, a new putative binding site at the CTD was found, explaining the antiproliferative activity of compounds such as the retired antibiotic novobiocin, but its structure hasn’t yet been clarified, hindering the efforts to develop new, safer and more effective, therapies.
In this report, an attempt is made at the synthesis of a photoaffinity labelling molecular probe, to be used in a mass spectrometry assisted structural characterization of the CTD binding site, based on the current SAR models available for Hsp90 CTD inhibitors, derived from novobiocin.
A proteína de choque térmico de 90 kDa (Hsp90) é uma proteína chaperona, responsável pela regulação de grande variedade de proteínas citoplasmáticas, através da assistência ao seu correto folding. A expressão desta proteína está por vezes aumentada em certos tipos de tumores, onde, através da sua ação, permite que proteínas meta-estáveis se mantenham ativas e escapem aos mecanismos de degradação biológicos. Com efeito, a Hsp90 tornou-se desde há duas décadas um interessante foco de estudo como possível alvo para uma nova geração de fármacos antitumorais, existindo já fármacos em ensaios clínicos. Estes atuam sobre o já conhecido NTD, contudo apesar de representarem um avanço considerável em termos médicos, estas moléculas apresentam geralmente farmacocinética desfavorável e um efeito secundário preocupante de poderem provocar resposta paradoxal. Foi recentemente identificado um novo local de ação ao nível do CTD que poderá representar um alvo terapêutico promissor para uma nova geração de fármacos mais eficazes e seguros, mas o desenvolvimento de moléculas direcionadas a este alvo tem sido lento uma vez que ainda não foi possível esclarecer a sua estrutura. Neste relatório descreve-se a tentativa de sintetizar uma nova molécula para ser utilizada como sonda de marcação por foto-afinidade numa experiência, assistida por espectrometria de massa, de identificação estrutural da cadeia polipeptídica do local de ação do CTD. O design desta sonda tem por base a novobiocina, como inibidor deste local mais estudado, e os modelos de SAR já existentes.
A proteína de choque térmico de 90 kDa (Hsp90) é uma proteína chaperona, responsável pela regulação de grande variedade de proteínas citoplasmáticas, através da assistência ao seu correto folding. A expressão desta proteína está por vezes aumentada em certos tipos de tumores, onde, através da sua ação, permite que proteínas meta-estáveis se mantenham ativas e escapem aos mecanismos de degradação biológicos. Com efeito, a Hsp90 tornou-se desde há duas décadas um interessante foco de estudo como possível alvo para uma nova geração de fármacos antitumorais, existindo já fármacos em ensaios clínicos. Estes atuam sobre o já conhecido NTD, contudo apesar de representarem um avanço considerável em termos médicos, estas moléculas apresentam geralmente farmacocinética desfavorável e um efeito secundário preocupante de poderem provocar resposta paradoxal. Foi recentemente identificado um novo local de ação ao nível do CTD que poderá representar um alvo terapêutico promissor para uma nova geração de fármacos mais eficazes e seguros, mas o desenvolvimento de moléculas direcionadas a este alvo tem sido lento uma vez que ainda não foi possível esclarecer a sua estrutura. Neste relatório descreve-se a tentativa de sintetizar uma nova molécula para ser utilizada como sonda de marcação por foto-afinidade numa experiência, assistida por espectrometria de massa, de identificação estrutural da cadeia polipeptídica do local de ação do CTD. O design desta sonda tem por base a novobiocina, como inibidor deste local mais estudado, e os modelos de SAR já existentes.
Descrição
Trabalho Final de Mestrado Integrado, Ciências Farmacêuticas, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia, 2014
Palavras-chave
Hsp90 Proteomics Photoaffinity labelling Novobiocin derivatives SAR of CTD inhibitors Mestrado Integrado - 2014