Publicação
Constituição e valorização da coleção ficológica do herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI), Instituto Superior de Agronomia
| datacite.subject.fos | Ciências Naturais::Ciências Biológicas | pt_PT |
| dc.contributor.advisor | Cotrim, Helena Maria da Conceição | |
| dc.contributor.advisor | Espírito Santo, Maria Dalila Paula Silva Lourenço do | |
| dc.contributor.author | Santos, João Carlos Canilho | |
| dc.date.accessioned | 2023-08-21T15:15:19Z | |
| dc.date.available | 2023-08-21T15:15:19Z | |
| dc.date.issued | 2023 | |
| dc.date.submitted | 2023 | |
| dc.description | Tese de Mestrado, Ecologia Marinha, 2023, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências | pt_PT |
| dc.description.abstract | As Coleções de História Natural e Herbários são alvo de interesse renovado depois de décadas de relativo esquecimento por parte da comunidade científica. Continuam a ser a principal fonte de descoberta e subsequente descrição formal de novas espécies para a ciência. As Coleções Ficológicas têm mais de um milhão e 700 mil espécimes preservados em Herbários europeus, número significativamente mais baixo comparativamente ao das plantas vasculares, devido a fatores como a maior dificuldade de amostragem e menor número de especialistas. Estudos reportam que os sistemas costeiros têm sofrido alterações ecológicas dramáticas nos últimos 150 anos, consequência dos impactos antropogénicos e alterações climáticas, sendo as macroalgas um grupo particularmente afetado. Os herbários de macroalgas são fontes essenciais de estudo e conservação da biodiversidade, bem como um pilar que responde a diversas questões ecológicas. Apesar da grande extensão costeira de Portugal, as Coleções Ficológicas do país são escassas, pouco desenvolvidas e praticamente inacessíveis digitalmente. O conjunto de exemplares ficológicos existentes em LISI foram alvo de projeto exploratório em 2021/2022. O seu objetivo era catalogar e rever taxonomicamente os exemplares colocando-os ao serviço da comunidade científica através da constituição de coleções e incorporação dos vouchers digitalizados em bases de dados online. Foram constituídas 3 subcolecções sendo a mais significativa a Coleção de Macroalgas da Costa Continental Portuguesa. As subcoleções estudadas contabilizaram um total de 852 vouchers e mais de 1800 espécimes preparados, o dataset encontra-se disponível na plataforma GBIF. A utilização de DNA barcode em espécimes de macroalgas da coleção resultou na produção de sequências barcode de 10 espécimes para duas regiões genómicas, rbcL e UPA que permitiram a confirmação da sua identificação e foram publicadas no repositório BOLD. Este projeto fornecerá uma oportunidade de outras instituições de ensino abraçarem também as suas coleções há muito negligenciadas. | pt_PT |
| dc.description.abstract | Natural History Collections and Herbaria are now the subject of renewed interest after decades of relative neglect by the scientific community. Still being the main source of discovery and subsequent formal description of new species for science. Phycological Collections have more than one million and 700 thousand specimens preserved in European Herbariums, a significantly lower number when compared to vascular plants, due to factors such as greater sampling difficulty and fewer specialists. Several studies report that coastal systems have undergone dramatic ecological changes in the last 150 years, because of anthropogenic impacts and climate change, with macroalgae being a particularly affected group. Thus, macroalgae herbaria are essential sources for the study and conservation of this biodiversity, as well as a pillar that responds to several ecological questions. Despite having a large coastline, Portugal’s Phycological Collections are scarce, poorly developed, and practically inaccessible digitally. In 2021/2022 all the phycological specimens present at LISI were the focus of this exploratory project whose objective was to catalog it, taxonomically review the specimens and place it at the service of the scientific community through the incorporation of digitized vouchers into online databases. Three marine macroalgae collections were constituted and studied accounting for a total of 852 vouchers and more than 1800 specimens, being the Coleção de Macroalgas da Costa Continental Portuguesa themost important. All collections dataset is available on the GBIF platform. Confirmation of the identification of specimens from the collection using DNA barcode resulted in the identification of 10 specimens for two genomic regions, rbcL and UPA. The newly produced DNA barcodes from these macroalgae were deposited in BOLD repository. This project will provide an opportunity for other educational institutions embrace their long-neglected collections as well. | pt_PT |
| dc.identifier.tid | 203525205 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10451/58946 | |
| dc.language.iso | por | pt_PT |
| dc.relation | UID/AGR/04129/2020 | pt_PT |
| dc.subject | Coleção histórica | pt_PT |
| dc.subject | DNA barcode | pt_PT |
| dc.subject | Ficologia | pt_PT |
| dc.subject | Portugal | pt_PT |
| dc.subject | Taxonomia | pt_PT |
| dc.subject | Tese de mestrado - 2023 | pt_PT |
| dc.title | Constituição e valorização da coleção ficológica do herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI), Instituto Superior de Agronomia | pt_PT |
| dc.type | master thesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| rcaap.rights | openAccess | pt_PT |
| rcaap.type | masterThesis | pt_PT |
| thesis.degree.name | Mestrado em Ecologia Marinha | pt_PT |