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- Estudo para a construção de um caderno de desenho de aves : aves do Museu Nacional de Arte AntigaPublication . Galego, Maria Alice Fava de Jesus Cravina; Saraiva, Pedro António dos Santos; Calado, Maria Margarida Teixeira BarradasThis thesis addresses drawing as means for knowledge and memory of species. Birds guide our theoretical and graphic narrative; their drawing first appears on the stone surface of caves through a hand-made line done approximately thirty-six thousand years ago. Ever since then, the drawing of birds continued to be carried out on various supports, many of them observable and protected in museum rooms from the 17th century onwards. Many of these drawn birds, as in Nature, can go unnoticed by the less attentive observer. Thus, the main objective of this thesis is to build a Book of Drawings based on the observation of the birds that appear throughout the Lisbon’s National Museum of Fine Art’s permanent collection of works. The theoretical-artistic proposal is guided by a naturalistic approach which doesn’t have analogical pretensions relative to scientific drawing - the aim is for a drawing which allows quick identification of species as it happens with current Bird Guides, however with no preoccupations of obeying to the strict rule of profile representation so common and characteristic of the ornithological drawing. The thesis is organized into three parts, each covering a chronological line traced by the drawing of birds. The first one starts in prehistoric caves, where stone housed the first record of a bird, and ends in 21st century’s common bird guides; the second part analyses the drawing of six birds observable in two-dimensional artworks belonging to the collection of the National Museum of Ancient Art, in Lisbon, geographical space hosting the iconographic survey that serves as the basis for the artwork and third part of this thesis, divided into two moments - the survey of pieces where it is possible to observe birds and their subsequent identification in the Book of Drawings
- Eficácia e segurança das vacinas contra COVID-19 :Publication . Queiroz, Mariana Rodrigues; Sepodes, Bruno Miguel Nogueira; Rocha, João Pedro FidalgoA COVID-19 é uma doença infecciosa causada pelo vírus SARS-CoV-2, altamente transmissível, classificada como pandemia, pela Organização Mundial da Saúde, em janeiro de 2020. As vacinas foram identificadas como a melhor estratégia para redução da disseminação da doença, evitando complicacões de saúde que levam a mortalidade. Nesse contexto, esta dissertação tem como objetivo caracterizar a resposta regulamentar na União Europeia num contexto de pandemia e emergência de saúde pública. Para colheita do material bibliográfico, foram consultados artigos científicos em bases de dados eletrónicas, publicados nos últimos três anos, além de documentos oficiais nas diferentes agências regulamentares e nas empresas farmacêuticas, nos seus respetivos websites. Foram apresentadas e discutidas as características do vírus SARS-CoV-2 e suas variantes; os caminhos regulamentares para avaliação e aprovação de novos medicamentos na European Medicines Agency (EMA) e Food and Drug Administration (FDA), bem como a resposta do sistema regulamentar à necessidade de desenvolvimento de vacinas para o combate à pandemia de COVID-19. No período de 2020 a 2022 foram aprovadas as vacinas Cominarty, Spikevax, Vaxzevria, Janssen, Novavax e Valneva pela EMA para uso adulto e as vacinas Cominarty, Spikevax e Novavax para uso pediátrico. O maior desafio, durante este período, foi disponibilizar de forma acelerada as vacinas para a população e que as mesmas mantivessem os padrões de qualidade, eficácia e segurança, tendo em conta o aparecimento de variantes do vírus SARS-CoV-2 durante o desenvolvimento das vacinas. Para tal, a EMA e a FDA utilizaram métodos de avaliação acelerada como Fast Track, rolling review e Autorização de Introducão no Mercado Condicional, bem como um grupo de trabalho (Task Force) para auxiliar o CHMP (Comité dos Medicamentos para Uso Humano) na avaliação dessas vacinas. Constatou-se, ao final deste estudo, que o método de rolling review possibilitou que as vacinas estivessem disponíveis para a população em menos de um ano desde o início dos ensaios clínicos. As mesmas foram eficazes em conter a pandemia e diminuir o número de mortes, porém devido ao aparecimento de variantes do vírus SARS-CoV-2, em especial a VOC Omicron, a eficácia das primeiras vacinas aprovadas não foi suficiente para conter o número de casos de COVID-19. Por conseguinte, é importante que ocorra o contínuo desenvolvimento de vacinas que protejam os indivíduos também contra as variantes. Além disso, as reações adversas reportadas após o uso das vacinas desenvolvidas foram consideradas muito raras, mantendo a relação risco/benefício de todas as vacinas favorável. Por fim, sugere-se continuidade da análise dos dados de segurança bem como a utilização do método de rolling review em casos emergencias de saúde, e que os stakeholders mantenham sua atencão voltada as variantes do vírus SARS-CoV-2 tendo em vista que o número de infectados por SARS-CoV-2 ainda é significativo.
- Insight into pathogenomics and phylogeography of hypervirulent and highly-lethal Mycobacterium tuberculosis strain clusterPublication . Mokrousov, Igor; Vyazovaya, Anna; Shitikov, Egor; Badleeva, Maria; Belopolskaya, Olesya; Bespiatykh, Dmitry; Gerasimova, Alena; Perdigão, JoãoBackground The Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype is globally spread lineage with important medical properties that however vary among its subtypes. M. tuberculosis Beijing 14717-15-cluster was recently discovered as both multidrug-resistant, hypervirulent, and highly-lethal strain circulating in the Far Eastern region of Russia. Here, we aimed to analyze its pathogenomic features and phylogeographic pattern. Results The study collection included M. tuberculosis DNA collected between 1996 and 2020 in different world regions. The bacterial DNA was subjected to genotyping and whole genome sequencing followed by bioinformatics and phylogenetic analysis. The PCR-based assay to detect specific SNPs of the Beijing 14717-15-cluster was developed and used for its screening in the global collections. Phylogenomic and phylogeographic analysis confirmed endemic prevalence of the Beijing 14717-15-cluster in the Asian part of Russia, and distant common ancestor with isolates from Korea (> 115 SNPs). The Beijing 14717-15-cluster isolates had two common resistance mutations RpsL Lys88Arg and KatG Ser315Thr and belonged to spoligotype SIT269. The Russian isolates of this cluster were from the Asian Russia while 4 isolates were from the Netherlands and Spain. The cluster-specific SNPs that significantly affect the protein function were identified in silico in genes within different categories (lipid metabolism, regulatory proteins, intermediary metabolism and respiration, PE/PPE, cell wall and cell processes). Conclusions We developed a simple method based on real-time PCR to detect clinically significant MDR and hypervirulent Beijing 14717-15-cluster. Most of the identified cluster-specific mutations were previously unreported and could potentially be associated with increased pathogenic properties of this hypervirulent M. tuberculosis strain. Further experimental study to assess the pathobiological role of these mutations is warranted.
- Silicon: Transcellular and Apoplastic Absorption and Transport in the XylemPublication . Ferreira Barreto, Rafael; Barão, LúciaSilicon (Si) is a beneficial element for plants, which helps mitigate various biotic and abiotic stresses. Under similar conditions, plant species have different abilities to accumulate Si. As the benefits of Si are generally related to its amount absorbed, some plant species benefit more from Si fertilization compared to others. Thus, three modes of Si uptake were proposed: active, passive, and rejection. Two different types of Si transporter [Low Silicon 1 (Lsi1) and 2 (Lsi2)] involved in the uptake and distribution of Si have been identified. Lsi1 functions as an influx transporter for Si, whereas Lsi2 functions as an efflux transporter of Si. These transporters located in the plasma membrane and have different expression patterns and tissue or cellular locations in different plant species that are associated with different levels of Si accumulation. These and other aspects are presented in the chapter.
- De Lisboa às serras : a evolução de Eça de QueirozPublication . Kampschroer, Philipp Michael; Tamen, Miguel Bénard da CostaA grande questão na tradição crítica sobre Eça de Queiroz (1845-1900) é sem dúvida a questão da sua evolução. Esta tese desenvolve um argumento sobre o percurso do escritor, considerando que as transformações globais da sua obra se materializam na transição referida no título. No período que se estende da publicação d’As Farpas (1871/72) a Os Maias (1888), a cidade de Lisboa parece ser o centro dos interesses de Eça. Nos romances e contos tardios predominam cenários do Norte de Portugal, já prenunciados no romance de 1888, que, em geral, consideramos um livro de transição. No capítulo I serão analisadas as cidades e paisagens, do primeiro Crime do Padre Amaro a Os Maias. Chegamos à conclusão de que a diluição, n’Os Maias, da claustrofobia urbana, que era palpável na Lisboa d’O Primo Basílio (1878), anuncia a referida predominância dos cenários nortenhos nas obras posteriores. No capítulo II demonstramos que praticamente todas as obras queirozianas são histórias de dois lugares, com uma dinâmica entre cidade e província. Veremos que há, no plano cronológico, uma reconfiguração dessa questão. O terceiro capítulo descreve a substituição das histórias de intrusões (p. ex. Basílio) por histórias de mudanças de casa (p. ex. A Cidade e as Serras; póstumo, escrito na década de 1890). Os capítulos IV e V têm o intuito de nos encaminhar a um argumento geral sobre a evolução queiroziana. Este argumento consiste, por um lado, no aprofundamento da discussão dos significados das alterações descritas nos três primeiros capítulos e, por outro lado, na explicação das razões que levaram a essas alterações. O capítulo IV parte da teoria de Mário Sacramento sobre a evolução queiroziana, que visa demonstrar a formação de uma estética da ironia. Esta estética concerne o desenho da acção, o estilo, e a perda do carácter tético dos romances. Sacramento considera que Eça se aproxima de uma arte que descreve as suas inclinações mais íntimas, uma tese que aceitamos, ainda que com modificações. O capítulo V procura, com recurso às conclusões que foram tiradas até aí, descrever e explicar a evolução de Eça. A transição de Lisboa às Serras é homóloga de uma revalorização de Portugal que, ao longo da tese, é ponderada de forma diferenciada e pormenorizada.
- A influência de fatores ambientais, comportamentais e a eficácia da desparasitação na carga e prevalência de parasitas gastrointestinais de slow loris (Nycticebus javanicus e nycticebus coucang) e cuscus (Phalanger gymnotis), num centro de recuperação da IndonésiaPublication . Pereira, Rita Neves; Carvalho, Luís Manuel Madeira de; Hananto, Wahyu (Tutor)Os Slow Loris (Nycticebus coucang e N. javanicus) e os Cuscus (Phalanger gymnotis) residentes frequentes em centros de recuperação. É por isso importante determinar de que modo as instalações em que estes habitam, os seus comportamentos e as desparasitações efetuadas afetam o seu tipo e a carga parasitária gastrointestinais. No Cikananga Wildlife Rescue Center, na Indonésia, habitam onze Slow Loris e um Cuscus em três tipos diferentes de instalações: aéreas, com solo de betão e solo natural. Foram colhidas 86 amostras de fezes, posteriormente analisadas no laboratório do centro, com o método de Mini-FLOTAC. A positividade destas amostras foi 77,9% e foram identificados ovos/oocistos de Strongyloides sp., Capillaria sp., Enterobius sp., Ancylostomatidae, Hymenolepis diminuta, Eimeria sp. e Eimeria pachylepyron. Foi demonstrada uma diferença estatisticamente relevante entre a carga parasitária dos indivíduos das instalações de solo natural (99,17%), de solo de betão (0,75%) e nas do tipo aéreo, sendo esta a mais baixa (0,08%). Foram efetuadas medições de temperatura (ºC), humidade relativa (%) e luz solar incidente (%). Esta última não pareceu ter impacto na carga parasitária dos indivíduos analisados. Contrariamente, embora não de modo linear, as instalações mais quentes e húmidas apresentaram maior carga parasitária que as mais frias e secas, sendo estatisticamente significativa a diferença da mediana do número de OPG/OoPG das instalações a diferentes temperaturas e humidades relativas As observações noturnas realizadas a estes animais demonstraram que poderá haver uma relação entre o aparecimento de animais infetados com H. diminuta e a presença de ratos nas instalações de solo natural. Para além disso, em termos comportamentais, os animais mais frequentemente observados no chão da instalação (≥ 50%) também parecem demonstrar ter maior carga parasitária do que os restantes. Porém, a frequência de alterações comportamentais e a interação entre indivíduos não aparenta ter influência no número de OPG/OoPG encontrados nas amostras. A desparasitação dos animais do estudo, na sua globalidade, revelou-se eficaz. Todavia, ao avaliar cada animal isoladamente, os animais das instalações do tipo aéreo aparentam demonstrar indícios de resistências a anti-helmínticos