Rodrigues, Tiago Correia de OliveiraRodrigues, Cecília Maria PereiraNeves, Joana Sofia Correia das2024-03-142024-03-142023-02-092022-12-16http://hdl.handle.net/10451/63415Tese de mestrado, Química Medicinal e Biofarmacêutica, 2023, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia.A necroptose é um tipo de morte celular necrótica regulada, caracterizada morfologicamente por uma perda geral da integridade celular e tem sido implicada na patogénese de várias doenças inflamatórias, infecciosas e degenerativas. Ao contrário da apoptose, a necroptose é independente de caspases e é mediada principalmente pela proteína de interação com recetor 1 (RIP1), RIP3 e o domínio de cinase de linhagem mista (MLKL), tornando as suas inibições um método inovador para modular a necroptose e trazer benefícios terapêuticos de valor translacional. Embora seja um alvo acionável, o espaço químico da RIPK3 permanece amplamente desconhecido, existindo, por isso, uma necessidade para o desenvolvimento de pequenas moléculas capazes de fornecer leads e fármacos por meio desse modo de ação inovador. Com este trabalho, pretendemos explorar o espaço de ligando da RIPK3 como estratégia para combater a necroptose. Para isso, tivemos um primeiro objetivo de otimizar um hit identificado numa colaboração entre o iMed e a Astrazeneca, através da síntese de uma biblioteca focada de 10-15 pequenas moléculas que permitiriam a determinação de características-chave para o a ligação ao alvo e forneceriam informações preliminares de SAR. Embora este objetivo não tenha sido cumprido, foram sintetizados os intermediários da molécula hit, o que forneceu informações importantes acerca da sua atividade. O segundo objetivo deste projeto foi a expansão espaço químico da RIPK3, com o intuito de gerar uma série potencial de reserva para desenvolvimento futuro, através de métodos computacionais. Foi feito um primeiro screening virtual através de pesquisa por semelhança, utilizando a molécula identificada pelo iMed/Astrazeneca como template e aproximadamente 400.000 pequenas moléculas obtidas através de bibliotecas de vários vendedores. Este levou à identificação do composto A2, com bons resultados nos ensaios celulares de necroptose. De seguida, foi feito um segundo screening virtual, desta vez utilizando o composto A2 como template; no entanto, os compostos selecionados para ensaios biológicos tiveram apenas atividade moderada a baixa. Ainda assim, a identificação do composto A2 representa um bom ponto de partida para o desenvolvimento futuro de outros inibidores de necroptose.porNecroptoseProteína Cinase de Interação com Recetor 3InibidorScreening virtualTeses de mestrado - 2023master thesis203260821