Tenreiro, Rogério Paulo de AndradePhilips, Alan J. L.Santos, Jorge Manuel2010-07-272010-07-272008http://catalogo.ul.pt/F/?func=item-global&doc_library=ULB01&type=03&doc_number=000566084http://hdl.handle.net/10451/1361Tese de mestrado, Biologia (Biologia Molecular e Genética), 2008, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasAs espécies anamórficas do género Phomopsis e os seus teleomorfos Diaporthe são endófitas e patogénicas numa vasta gama de hospedeiros vegetais, sendo responsáveis por diversas doenças, por vezes em plantas de interesse económico. Até à data, as espécies destes géneros têm sido definidas maioritariamente pela associação ao hospedeiro, e secundariamente pela sua micromorfologia. Contudo, trabalhos recentes demonstram que, devido à vasta gama de hospedeiros de certas espécies, a associação ao hospedeiro representa um carácter taxonómico de menor importância. Por sua vez, a plasticidade dos caracteres morfológicos e a sua sobreposição em espécies distintas, torna-os insuficientes para este objectivo. É portanto urgente uma revisão destes géneros para que conceitos morfológicos, biológicos e filogenéticos de espécie fidedignos possam ser aplicados a estes organismos. A estratégia adoptada para rever géneros tão vastos consistiu em seleccionar um hospedeiro de cada vez e caracterizar todas as espécies que nele ocorrem. Neste trabalho, uma intensiva recolha de Phomopsis e Diaporthe encontrados em Foeniculum vulgare ao longo de Portugal foi realizada, e, desta forma, uma colecção de isolados foi estabelecida. Os isolados foram caracterizados e agrupados de acordo com os seus perfis de MSP-PCR. Isolados representativos foram seleccionados para a construção de uma filogenia molecular baseada na região ITS do rDNA (ITS1 5.8S ITS2). Os tipos conjugantes dos isolados foram diagnosticados por PCR, numa abordagem racional para a indução de teleomorfos in vitro. Para este efeito, primers universais para os loci MAT de Diaporthe foram desenhados. Conciliando dados morfológicos, culturais e moleculares, quatros espécies foram encontradas em F. vulgare. Diaporthe angelicae surge como o principal patogéneo deste hospedeiro em Portugal. Uma nova espécie, Diaporthe lusitanicae, é descrita e um novo teleomorfo (Diaporthe neotheicola) é relacionado com o seu anamorfo. Espécimes holótipo e culturas ex-tipo destas duas últimas espécies foram depositados em herbário e colecção pública de culturasAnamorphic Phomopsis species and their Diaporthe teleomorphs are endophytes and pathogens on a wide range of plant hosts, being responsible for several diseases, sometimes in plants of economic importance. Until now, species within these genera have been described mainly on the basis of host association, and to a lesser extent on their micromorphology. However, recent studies have revealed that host association is of minor taxonomic importance, due to the wide host ranges of some species. On the other hand, morphological characters are not always suitable for species definition because of their plasticity and overlapping between distinct species. Therefore, a revision of these genera is needed so that reliable morphological, biological and phylogenetic species concepts can be established. The approach selected for revising such large genera was to study a single host at a time and fully characterize all the species that occur on it. In this study, an intensive sampling of Phomopsis species and Diaporthe teleomorphs found on Foeniculum vulgare throughout Portugal was done and a collection of isolates was established. Isolates were characterized and grouped according to their MSP-PCR profiles. Representative isolates were selected for a molecular phylogeny based on the rDNA ITS region (ITS1 5.8S ITS2). Mating types were diagnosed by PCR means, towards a rational strategy for the induction of teleomorphs in vitro. For this purpose, universal primers for the MAT loci of Diaporthe were designed. Combining morphological, cultural and molecular data, four species were distinguished from F. vulgare. Diaporthe angelicae is the main pathogen of this host in Portugal. A new species, Diaporthe lusitanicae, is described and the teleomorph of Phomopsis theicola (Diaporthe neotheicola) is connected to its anamorph and described as a new species. Holotype specimens and ex-type cultures for these last two species were deposited in an international, publicly accessible herbarium and culture collectionapplication/pdfporBotânica sistemáticaTaxonomiaTeses de mestradomaster thesis