Pomba, Maria Constança Matias FerreiraLourenço, Ana Mafalda Gonçalves Xavier FélixSilva, Pedro Guilherme Braz Pinto2021-06-202021-06-202021-05-07Silva PGBP 2021. Dynamics of companion animal to human transmission of antimicrobial resistance, during skin and soft tissue companion animal infection [masther thesis]. Lisboa: FMV-Universidades de Lisboahttp://hdl.handle.net/10400.5/21490Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina VeterináriaABSTRACT - Objective: This study aims to characterize the dynamics of antibiotic resistance gene transmission in dogs with skin and soft tissue infections (SSTI) and human beings co habiting with them. We also aim to evaluate the gut colonization of these individuals for the presence of extended spectrum beta-lactamases (ESBL’s) in Enterobacteriaceae and to assess the effect of antibiotherapy on the selection of MDR bacteria from human and canine gut microbiota. Methods: Two types of biological samples were gathered in a teaching veterinary hospital in Portugal, at the dermatology department, from twelve dogs diagnosed with SSTI and their household members. Collections included a swab from the infection site (ISS) and a faecal sample (FS). Gathering of samples was performed at two different times. The ISS were cultured and an AST was performed. The FS was also cultured, and the bacteria isolated subjected to molecular analysis. Antibiotic resistance patterns were obtained by disk diffusion antimicrobial susceptibility’s testing and Enterobactereaceae ESBL’s production was confirmed by amplification of the specific gene by PCR and sequencing. Results: High levels of Methicillin resistant Staphylococcus pseudintermedius (MRSP) were isolated, and high levels of other multidrug resistant bacteria (MDR) as well. One family was suspected of carrying the same E. coli clone, shared by two humans and one dog of the same household, with a blaCTX-M-15 gene. All of the isolated Enterobactereaceae displayed susceptibility to carbapenems. The most common ESBL genes found were from the blaCTX-M group, followed by blaOXA-1 and then blaTEM, no gene from the blaSHV gene was found. Conclusions: There is a high prevalence of ESBL-producing E. coli. Interspecies transmission of antimicrobial resistance is real. This issue should be addressed with introduction of antimicrobial stewardship strategies on a wider scale and better use of antimicrobials like chlorohexidine, especially in SSTI.RESUMO - Esta dissertação enquadra-se nos objetivos de um projeto muito maior e ainda mais ambicioso, chamado PetRisk. Pretende-se analisar o impacto e as interações dos genes de resistência aos antibióticos, percebendo de que forma as barreiras interespécie podem ser ultrapassadas. Assim sendo, o estudante integrou o núcleo desse mesmo empreendimento em Portugal, o Laboratório de Resistência aos Antibióticos da FMV-UL, liderado pela Professora Doutora Constança Pomba. Objetivo: Este estudo teve como objetivo principal compreender a dinâmica de transmissão de genes de resistência aos antibióticos, entre cães com infeção de pele e tecidos moles e as pessoas com quem vivem em regime de co-habitação. Pretendeu-se avaliar a colonização do tubo digestivo desses mesmos indivíduos quanto à presença de Enterobactereacea produtoras de beta-lactamases de largo expectro e verificar o efeito da antibioterapia na seleção de estirpes multiresistentes da microbiota intestinal canina e humana. Outro obejtivo da realização deste trabalho é o de aumentar os recursos biológicos – com isto subentende-se, bactérias de diferentes agregados familiares e o seu perfil de resistência aos antimicrobianos – para o projeto mãe, o PetRisk. Métodos: Para tal, recolheram-se dois tipos de amostras biológicas no departamento de dermatologia do hospital veterinário escolar da FMV-ULisboa. A amostra inclui doze cães com infeções de pele e tecidos moles, assim como os restantes membros do seu agregado familiar. Os materiais recolhidos foram zaragatoas do local de infeção (ZLI) e amostras fecais (AF). As colheitas decorreram em dois tempos diferentes. Às ZLI após cultura microbiológica realizaram-se testes de suscetibilidade aos antibióticos de rotina. Os isolados provenientes das AF foram sujeitos a cultura microbiológica e análise molecular. Os padrões de resistência aos antibióticos foram obtidos pelo método de difusão de discos e a confirmação da produção das beta-lactamases de largo expectro pelas Enterobactereaceae por amplificação do respetivo gene por PCR e sequenciação. Resultados: Foram encontrados elevados níveis de Staphylococcus resistentes à meticilina, assim como a resistência a multiplos antibióticos. Também as nas Escherichia coli provenientes das AF foram encontrados elevados nívreis de resistência a múltiplos antibióticos. Uma familia foi suspeita de partilhar o mesmo clone de E.coli (duas pessoas e um cão) com o mesmo filogrupo e o gene blaCTX-M-15. Todas as Enterobactereaceae isoladas demonstraram suscetibilidade aos carbapenemos. Os genes de beta-lactamases de largo expectro detetados foram (da maior para a menor frequência): blaCTX-M , blaOXA-1 e blaTEM, com nenhum registo de blaSHV. Conclusões: Existe uma elevada prevalência de E. Coli produtoras de beta-lactamases de largo expetro. A transmissão de informação genética inter-espécies é uma realidade. A prática clínica beneficiaria de uma administração mais prudente e integrada de antibióticos, com uma equipa a trabalhar apenas para a gestão destes recursos num hospital, assim como maior atenção ao uso de antisséticos como a clorohexidina, especialmente em infeções de pele e tecidos moles onde os produtos disponivéis são de fácil aplicação.engMethicillin resistant Staphylococcus pseudintermediusEscherichia coliExtended spectrum beta-lactamasesMultidrug resistanceSkin and soft tissue infectionStaphylococcus pseudintermedius Meticilina resistentesEscherichia coliBeta-lactamases de largo expetroResistência a multiplos antibioticosInfeções de pele e tecidos molesmaster thesis202745066