Sousa, Lisete Maria Ribeiro de,1972-Sebastiana, Mónica Guita,1967-Bento, Bruno de Campos2020-12-112020-12-1120202020http://hdl.handle.net/10451/45262Trabalho de projeto de mestrado em Bioestatística, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2020A associação simbiótica entre as raízes e fungos micorrízicos do solo é extremamente importante para a nutrição e desenvolvimento das plantas. Apesar de haver já algum conhecimento sobre os genes (genoma/transcritoma) e proteínas (proteoma) envolvidos no processo de micorrização, sabe-se muito pouco sobre as alterações dos metabolitos da planta hospedeira quando esta se encontra em simbioses com o fungo micorrízico. Assim, a identificação do conjunto de metabolitos ou compostos biológicos (metaboloma) envolvidos na micorrização reveste-se de especial interesse para completar a informação fornecida pelo genoma/transcritoma e proteoma. Estes são os últimos produtos da expressão dos genes e, por isso, são extremamente informativos acerca das alterações moleculares que estão a acontecer nos organismos vivos. Sabe-se que os organismos vivos sujeitos a stresses ambientais (e.g. seca, salinidade do solo) ou durante interações com microrganismos simbióticos ou patogénicos, podem produzir metabolitos específicos ou sofrer alterações na quantidade de metabolitos já produzidos. A identificação destas alterações permite saber, a nível molecular, o que está a acontecer quando uma planta estabelece, por exemplo, uma relação simbiótica com um fungo da rizosfera. Neste estudo pretendeu-se contribuir para a identificação das alterações no metaboloma do sobreiro quando este se encontra em simbiose com um fungo micorrízico do solo. O metaboloma da raíz micorrizada do sobreiro foi extraído usando quatro frações compostas por diferentes solventes: água, metanol, acetonitrilo e clorofórmio (orgânica). Foram extraídas seis réplicas de plantas de sobreiros – sendo três micorrizadas e três utilizadas como grupo de controlo não micorrizado, para efeitos de comparação. Através da aplicação de métodos estatísticos tais como Rank Products, Modelos Lineares e Análise Discriminante por Mínimos Quadrados Parciais (PLS-DA) , foi possível a identificação dos metabolitos diferencialmente acumulados que possibilitarão a descoberta de novas informações sobre a identidade dos metabolitos envolvidos na simbiose entre o sobreiro e o fungo micorrízico, promovendo novos conhecimentos sobre as vias metabólicas implicadas na micorrização.The symbiotic association between roots and mycorrhizal fungi is extremely important for plant nutrition and development. Although there is already some knowledge about the genes and proteins involved in the mycorrhization process, very little is known about changes in the host plant metabolome when in symbiosis with the mycorrhizal fungus. Thus, the identification of the set of metabolites or biological compounds involved in mycorrhization (metabolome) is of particular interest to supplement the information provided by the transcriptome (transcript) and proteome (protein). These are the latest products of gene expression and are therefore extremely informative about the molecular changes that are happening in living organisms. It is well known that living organisms produce specific metabolites or suffer alterations in metabolite levels when subjected to environmental stresses (e.g. drought, soil salinity) or interactions with microorganisms, pathogenic or symbiotic. By identifying these changes, it is possible to know at a molecular level what is happening when a plant establishes a symbiotic relationship. The aim of this study was to contribute for the identification of changes in the metabolome of the cork oak during symbiosis with a soil mycorrhizal fungus. The mycorrhizal root metabolome was extracted using four fractions composed of different solvents: water, methanol, acetonitrile and chloroform (organic). Six replicates of cork oak plants were extracted − three mycorrhizal and three used as non-mycorrhizal control group for comparison. Through the application of statistical methods for linear models of microarray data, like Rank Products and Linear Models, and PLS-DA (Partial Least Squares Discriminant Analysis), it was possible to identify the differentially accumulated metabolites that will allow the discovery of new information about the identity of the metabolites involved in the symbiosis between cork oak and the mycorrhizal fungus, allowing new knowledge about the metabolic pathways involved in mycorrhizal symbiosis.porEctomicorrizasQuercus suber L.MetabolitosRank ProductsAnálise discriminante por mínimos quadrados parciaisTeses de mestrado - 2020master thesis202599353