Santos, Nuno Gonçalo Carvalho Caroço dosAlmeida, Virgílio da SilvaSousa, Marta Mendes de2025-03-012025-03-012025-02-05Sousa MM. 2025. Mortality trends of the Oryctolagus cuniculus algirus in the wilderness of Portugal [master's thesis]. Lisboa: FMV-Universidade de Lisboahttp://hdl.handle.net/10400.5/98938Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina Veterinária, área científica de Sanidade AnimalThe wild European rabbit (Oryctolagus cuniculus algirus) is a keystone species native to the Iberian Peninsula. In its habitat, is endangered, posing a threat to the biodiversity that relies on it. Its populational declines are largely attributed to myxomatosis (MYX), rabbit haemorrhagic disease (RHD GI.2), hunting, and habitat degradation as a result of human activities. This study investigated how wild rabbit survival is influenced by age group, sex, season of birth, vaccination, serological status for MIX and RHD GI.2, presence of myxomas, food availability, predation pressure and population density. Two free-living wild populations were compared with two enclosed populations, in Portugal, between 2018 and 2023. The enclosed populations were vaccinated, protected from mammalian predators and supplemented with feed ad libitum. Data was analyzed using Bayesian models with the BaSTA package in RStudio. MIX and RHD were an important cause of mortality regardless of age. Seropositivity increased survival. In the enclosures, males over 4 months old registered higher mortalities, likely due to increased competition in high population densities. On the other hand, the absence of predators extended rabbit lifespan. Vaccination against RHD GI.2 only improved survival in some circumstances, while MYX seemed to be linked to higher mortalities. The time of birth was critical for survival, with winter-born rabbits more likely to reach sexual maturity. Predation only weakened low-density populations, as density-stable populations withstood moderate levels of predatory pressure. Effective conservation strategies consider the complex interplay between intrinsic and environmental factors. Vaccination strategies can be improved through better selection of the rabbits to be vaccinated. More investment is needed to strike an optimal balance between minimising harm to rabbits and maximising the benefits of the applied management measures, while preserving the species' natural habitat, essential for a long-term population sustainabilityRESUMO – TENDÊNCIAS DE MORTALIDADE DO ORYCTOLAGUS CUNICULUS ALGIRUS EM ÁREAS COM APTIDÃO PARA A VIDA SELVAGEM EM PORTUGAL - O coelho-bravo europeu (Oryctolagus cuniculus algirus) é uma espécie-chave nativa da Península Ibérica. No seu habitat, o coelho-bravo está em perigo de extinção, ameaçando também a biodiversidade que dele depende. O declínio das suas populações deve-se maioritariamente à introdução da mixomatose (MIX) e da doença hemorrágica viral (DHV), à caça e à degradação do habitat, fruto das atividades humanas. Este estudo investigou de que forma a sobrevivência do coelho-bravo é influenciada pela faixa-etária, sexo, época de nascimento, vacinação, estatuto serológico para MIX e DHV GI.2, presença de mixomas, disponibilidade de alimento, pressão de predação e densidade populacional. Foram comparadas duas populações selvagens de vida livre com duas populações mantidas em cercados, em Portugal, entre 2018 e 2023. As populações nos cercados foram vacinadas, protegidas de predadores mamíferos e suplementadas com ração à discrição. A análise dos dados usou modelos Bayesianos com o pacote BaSTA no RStudio. MIX e DHV foram uma causa importante de mortalidade, independentemente da idade. A seropositividade favoreceu a sobrevivência. Nos cercados, observou-se uma maior mortalidade dos machos com mais de 4 meses de idade, provavelmente pela competição derivada de densidades elevadas. Por outro lado, a ausência de predadores aumentou a longevidade destas populações. A vacinação contra a DHV GI.2 só melhorou a sobrevivência em algumas circunstâncias, enquanto a vacinação contra a MIX pareceu estar associada a uma maior mortalidade. A época de nascimento também foi importante para a sobrevivência pois os coelhos nascidos no inverno tiveram maior probabilidade de alcançarem a maturidade sexual. A predação apenas prejudicou as populações com densidades baixas. As populações estáveis toleraram bem, níveis de predação moderados. As estratégias de conservação eficazes consideram a complexa interação entre fatores intrínsecos e ambientais. As estratégias de vacinação podem ser melhoradas através de uma seleção dos coelhos a vacinar. É impreterível um maior investimento para atingir o ponto ótimo entre o mínimo de coelhos lesados e o máximo de coelhos beneficiados com as práticas de maneio instituídas para preservar o habitat natural da espécie, crucial para a sustentabilidade das populações a longo prazoengEuropean rabbitSurvival and mortality trendsBayesian AnalysisMyxomatosisRabbit Haemorrhagic DiseaseCoelho-bravoTendências de sobrevivência e mortalidadeAnálise BayesianaMixomatoseDoença Hemorrágica Viralmaster thesis203915593