Publicação
In silico discovery and optimization of small molecules targeting neurodegenerative diseases
| datacite.subject.fos | Ciências Médicas::Ciências da Saúde | pt_PT |
| dc.contributor.advisor | Guedes, Rita Alexandra do Nascimento Cardoso | |
| dc.contributor.advisor | Martinho, Nuno Filipe Rodrigues | |
| dc.contributor.author | Assis, Diana Sofia Linhares | |
| dc.date.accessioned | 2025-05-21T14:41:34Z | |
| dc.date.available | 2025-05-21T14:41:34Z | |
| dc.date.issued | 2024-12-17 | |
| dc.date.submitted | 2024-10-25 | |
| dc.description | Tese de mestrado, Química Medicinal e Biofarmacêutica, 2024, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia. | pt_PT |
| dc.description.abstract | A doença de Alzheimer (AD) é uma condição neurodegenerativa progressiva que, compromete significativamente a função cognitiva e a memória. Globalmente, afeta aproximadamente 10 milhões de pessoas. Esta doença é caracterizada por um desenvolvimento acelerado e pela ausência de cura, o que reforça a urgência de identificar novas abordagens terapêuticas no tratamento de AD. Em 2023, a FDA aprovou o anticorpo Lecanemab, direcionado à proteína beta amiloide, para tratar doentes diagnosticados com AD. Porém, explorara novas abordagens terapêuticas alternativas continua a ser crucial. Investigação recente sugere uma ligação potencial entre a AD e o sistema orexinérgico, que desempenha um papel crucial na regulação circadiana e que está implicado na insónia, um sintoma comum da AD. Atualmente, o uso de moléculas fotossensíveis é uma estratégia inovadora para a neuro terapêutica. Neste estudo iremos abordar um grupo de compostos, os azobenzenos (AB), bastante utilizados e conhecidos por mudarem a sua conformação cis para trans sob exposição à luz. Desta forma, o principal objetivo deste projeto é o desenvolvimento e otimização de uma biblioteca de pequenas moléculas com características fotossensíveis tendo como principal alvo os recetores da orexina (tipo 1 e 2) através de métodos in silico. Para tal, foram realizadas várias análises computacionais tanto dos recetores de orexina como dos AB, de forma a avaliar a afinidade entre estes recetores e os compostos AB, com o objetivo, de determinar se estes podem atuar como antagonistas, sendo a sua a ação controlada pela luz. As metodologias in silico são conhecidas pela rapidez e precisão dos resultados e têm tido uma importância e um forte crescimento no processo de descoberta de novos medicamentos e terapias. Neste projeto foram realizadas análises de similaridade de Tanimoto, estudos de interações entre os compostos e o alvo (PDB ID:6TQ4), docking molecular, métodos quânticos e inteligência artificial. De entre todos os compostos analisados, o composto DA_006 destacou-se como sendo o candidato mais promissor, o que justifica a sua utilização em estudos futuros. | pt_PT |
| dc.description.abstract | A doença de Alzheimer (AD) é uma condição neurodegenerativa progressiva que, compromete significativamente a função cognitiva e a memória. Globalmente, afeta aproximadamente 10 milhões de pessoas. Esta doença é caracterizada por um desenvolvimento acelerado e pela ausência de cura, o que reforça a urgência de identificar novas abordagens terapêuticas no tratamento de AD. Em 2023, a FDA aprovou o anticorpo Lecanemab, direcionado à proteína beta amiloide, para tratar doentes diagnosticados com AD. Porém, explorara novas abordagens terapêuticas alternativas continua a ser crucial. Investigação recente sugere uma ligação potencial entre a AD e o sistema orexinérgico, que desempenha um papel crucial na regulação circadiana e que está implicado na insónia, um sintoma comum da AD. Atualmente, o uso de moléculas fotossensíveis é uma estratégia inovadora para a neuro terapêutica. Neste estudo iremos abordar um grupo de compostos, os azobenzenos (AB), bastante utilizados e conhecidos por mudarem a sua conformação cis para trans sob exposição à luz. Desta forma, o principal objetivo deste projeto é o desenvolvimento e otimização de uma biblioteca de pequenas moléculas com características fotossensíveis tendo como principal alvo os recetores da orexina (tipo 1 e 2) através de métodos in silico. Para tal, foram realizadas várias análises computacionais tanto dos recetores de orexina como dos AB, de forma a avaliar a afinidade entre estes recetores e os compostos AB, com o objetivo, de determinar se estes podem atuar como antagonistas, sendo a sua a ação controlada pela luz. As metodologias in silico são conhecidas pela rapidez e precisão dos resultados e têm tido uma importância e um forte crescimento no processo de descoberta de novos medicamentos e terapias. Neste projeto foram realizadas análises de similaridade de Tanimoto, estudos de interações entre os compostos e o alvo (PDB ID:6TQ4), docking molecular, métodos quânticos e inteligência artificial. De entre todos os compostos analisados, o composto DA_006 destacou-se como sendo o candidato mais promissor, o que justifica a sua utilização em estudos futuros. | pt_PT |
| dc.identifier.tid | 203878230 | pt_PT |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10400.5/100872 | |
| dc.language.iso | eng | pt_PT |
| dc.relation | HEU Project Tclock4AD GA number 101072895 | pt_PT |
| dc.relation | EXPL/QUI- OUT/1288/2021 | pt_PT |
| dc.relation | UIDB/04138/2020 | pt_PT |
| dc.relation | UIDP/04138/2020 | pt_PT |
| dc.relation | COMPETE LISBOA-01-0246- FEDER-000017 | pt_PT |
| dc.subject | Alzheimer`s Disease | pt_PT |
| dc.subject | Photoswitchable compounds | pt_PT |
| dc.subject | Orexin receptors | pt_PT |
| dc.subject | Small molecules | pt_PT |
| dc.subject | In silico methods | pt_PT |
| dc.subject | Teses de mestrado - 2024 | pt_PT |
| dc.title | In silico discovery and optimization of small molecules targeting neurodegenerative diseases | pt_PT |
| dc.type | master thesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| rcaap.rights | openAccess | pt_PT |
| rcaap.type | masterThesis | pt_PT |
| thesis.degree.name | Mestrado em Química Medicinal e Biofarmacêutica | pt_PT |